Chùa Yên Phú (thôn Yên Phú, xã Liên Ninh, huyện Thanh Trì, Hà Nội) xưa có tên chữ Thanh Vân cổ tự, sau đổi thành Khánh Hưng tự. Theo sử liệu, chùa Yên Phú hình thành vào thời Hai Bà Trưng, khoảng năm 40 đầu Công nguyên, thờ sư bà Phương Dung và hai người con nuôi Trung Vũ, Đài Liệu đã có công chiêu lập nghĩa quân, tham gia đánh quân Nam Hán dưới ngọn cờ khởi nghĩa của Hai Bà Trưng, được phong thần, tôn là thành hoàng làng. Năm 1789, trong trận Ngọc Hồi, chùa Yên Phú được vua Quang Trung chọn làm đại bản doanh của quân Tây Sơn. Kháng chiến chống Pháp 1947 - 1954, chùa là nơi nuôi giấu cán bộ Việt Minh. Trong kháng chiến chống Mỹ, chùa là kho hậu cần chi viện cho bộ đội Thủ đô. Chùa Yên Phú đã trải qua nhiều lần trùng tu, tôn tạo, gần đây nhất là năm 2011. Kiến trúc cổ duy nhất còn sót lại trong chùa là khu vườn tháp mộ. nhiều di vật quý như bản thần phả thời vua Lê Anh Tông, niên hiệu Hồng Phúc (1572); 23 đạo sắc phong thời Lê Trung hưng và thời Nguyễn, trong đó sắc sớm nhất là năm 1647, muộn nhất là năm 1924; 3 văn bia niên đại 1902, 1922, 1929; hệ thống hoành phi câu đối, đồ thờ; quả chuông “Thanh Vân tự chung” đúc năm 1890, 33 pho tượng mang phong cách nghệ thuật cuối thế kỷ XIX... Lễ hội chùa và hội làng Yên Phú diễn ra từ mùng 5 đến mùng 7 tháng Mười Một hằng năm, đến nay vẫn giữ nhiều phong tục truyền thống. Năm 1988, chùa Yên Phú được xếp hạng Di tích lịch sử quốc gia.